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मेथिलीन ब्लू और ऑटोफैजी: AMPK, mTOR और न्यूरॉन संबंधी प्रयोग

मेथिलीन ब्लू और ऑटोफैजी: AMPK, mTOR और न्यूरॉन संबंधी प्रयोग

कल्पना करें कि आप कोशिकाओं पर एक प्रयोग करते हैं, मेथिलीन ब्लू मिलाते हैं और अपने ब्लॉट पर LC3-II नामक प्रोटीन की पट्टी को अधिक गहरा होते देखते हैं। यह घोषणा करना आकर्षक लग सकता है कि यह यौगिक "ऑटोफैजी बढ़ाता है", और फिर आगे बढ़ जाना। ऐसा निष्कर्ष निकालना जल्दबाज़ी है। LC3-II की अधिक गहरी पट्टी का अर्थ यह हो सकता है कि कोशिका सफ़ाई के लिए अधिक पुटिकाएँ बना रही है। या इसका अर्थ यह हो सकता है कि पुटिकाएँ इसलिए जमा हो रही हैं क्योंकि अपशिष्ट के निपटान का चरण अवरुद्ध है। इन दोनों व्याख्याओं के निष्कर्ष विपरीत हैं, और न्यूरॉन संबंधी मेथिलीन ब्लू के शोध साहित्य में दोनों तरह के प्रमाण मिलते हैं। यह लेख प्रत्येक परीक्षण के आधार पर बताता है कि वास्तव में क्या मापा गया था।

यहाँ अध्ययन की गई प्रक्रिया, मैक्रोऑटोफैजी, कोशिका में सामग्री के सामूहिक पुनर्चक्रण की व्यवस्था है। फागोफोर नामक झिल्ली की एक थैली पुराने या क्षतिग्रस्त प्रोटीनों और कोशिकांगों के चारों ओर बढ़ती है, बंद होकर ऑटोफैगोसोम बनती है और लाइसोसोम से जुड़ जाती है। इसके भीतर की सामग्री का विघटन होता है और उसे दोबारा उपयोग के लिए मुक्त कर दिया जाता है। न्यूरॉन इस नियमित प्रक्रिया पर निर्भर होते हैं क्योंकि वे विभाजित नहीं होते और विभाजन के ज़रिए क्षतिग्रस्त घटकों का अनुपात कम नहीं कर सकते। पुनर्चक्रण रुकने पर अपशिष्ट जमा होता है। इसके चलते रहने पर कोशिका तनाव की स्थिति में निर्माण के लिए आवश्यक घटक वापस प्राप्त करती है।

हिप्पोकैम्पस से संबंधित एक प्रयोग में क्या दिखा

ऑटोफैजी की शुरुआत से संबंधित मुख्य अध्ययन में चूहे की हिप्पोकैम्पस कोशिकाओं की HT22 कोशिका रेखा का उपयोग किया गया। इन कोशिकाओं को 24 घंटे तक सीरम से वंचित रखकर तनाव दिया गया। इस स्थिति में वृद्धि कारक और कोशिकाओं के पोषण तथा अस्तित्व को सहारा देने वाले संकेत हट जाते हैं, जिससे एपोप्टोसिस और ऑटोफैजी दोनों शुरू होते हैं। शोधकर्ताओं ने बताया कि मेथिलीन ब्लू ने सांद्रता पर निर्भर तरीके से कोशिका मृत्यु घटाई, और इस संरक्षण के साथ मैक्रोऑटोफैजी के संकेत भी मिले।

मार्करों में देखे गए बदलाव विशिष्ट थे। लगभग 20 nM मेथिलीन ब्लू से शुरू होकर, कोशिका में फैला हुआ LC3B अभिरंजन केंद्रक के आसपास बिंदुनुमा समूहों में पुनर्वितरित होने लगा। LC3-I और LC3-II की सबसे प्रबल प्रतिक्रिया लगभग 1 μM पर मिली। LC3B-I और LC3B-II दोनों सांद्रता और समय पर निर्भर तरीके से बढ़े। एक महत्वपूर्ण बात यह थी कि टीम ने केवल किसी एक समय-बिंदु पर LC3 ब्लॉट देखने तक परीक्षण सीमित नहीं रखा। उन्होंने 10 μM क्लोरोक्वीन मिलाया, जो लाइसोसोम द्वारा सामग्री के निपटान को रोकता है, और मेथिलीन ब्लू से उपचारित कोशिकाओं में LC3-II का अधिक स्तर तथा p62 का स्थिर बने रहना पाया। यह पैटर्न केवल सामग्री जमा होने के बजाय लाइसोसोम पर निर्भर टर्नओवर का समर्थन करता है। उन्होंने यह भी दिखाया कि क्लोरोक्वीन ने एपोप्टोसिस को कम करने वाले प्रभाव को आंशिक रूप से उलट दिया। इससे इस मॉडल में संरक्षण का संबंध ऑटोफैजी और लाइसोसोम मार्ग से जुड़ता है।

सिग्नलिंग से संबंधित निष्कर्ष को सबसे अधिक गलत तरीके से उद्धृत किया जाता है। फॉस्फोरिलेटेड AMPK और उसके आगे के लक्ष्य, फॉस्फोरिलेटेड ACC, के आधार पर मापी गई AMPK सिग्नलिंग 12 और 24 घंटे पर सांद्रता पर निर्भर तरीके से बढ़ी। अंतिम 4 घंटे के दौरान 20 μM पर दिए गए AMPK अवरोधक Compound C ने ACC फॉस्फोरिलेशन और LC3 सक्रियण दोनों को घटाया। इसके विपरीत, फॉस्फोरिलेटेड mTOR में कोई पता लगाने योग्य दमन नहीं दिखा। इसलिए तनावग्रस्त हिप्पोकैम्पस कोशिकाओं में निष्कर्ष यह था कि ऑटोफैजी की शुरुआत AMPK से जुड़ी थी और एक ऐसे मार्ग से हुई जो प्रत्यक्षतः mTOR से स्वतंत्र था। यही पैटर्न जीवित चूहों में भी दिखा, जहाँ मेथिलीन ब्लू उपचार से कॉर्टेक्स और हिप्पोकैम्पस में मैक्रोऑटोफैजी के मार्कर बढ़े।

शुरुआत का अर्थ पूर्ण फ्लक्स नहीं है

यहाँ अवधारणाओं के बीच अंतर सबसे महत्वपूर्ण है। शुरुआत का अर्थ है कि शुरुआती चरणों की प्रणाली अधिक ऑटोफैगोसोम बनाती है। फ्लक्स का अर्थ है कि सामग्री पूरे मार्ग से गुज़रती है: अलग करके घेरना, परिपक्व होना, लाइसोसोम से जुड़ना, विघटन और पुनर्चक्रण। जब तक फ्लक्स परीक्षण शेष प्रक्रिया की पुष्टि न करे, LC3-II में हर वृद्धि को ऑटोफैजी की शुरुआत का दावा ही माना जाना चाहिए।

मानक फ्लक्स परीक्षण में LC3-II को लाइसोसोम के अल्पकालिक अवरोध, जैसे बैफिलोमाइसिन A1 या क्लोरोक्वीन, की मौजूदगी और अनुपस्थिति में मापा जाता है। यदि उपचार वास्तव में निर्माण की गति बढ़ाता है, तो विघटन रोकने पर LC3-II और अधिक बढ़ना चाहिए। टैंडम mCherry-GFP-LC3 रिपोर्टर एक दूसरा दृष्टिकोण देता है: लाइसोसोम से जुड़ने से पहले संरचनाएँ पीली चमकती हैं और अम्लीय वातावरण में GFP संकेत बुझ जाने के बाद केवल लाल चमकती हैं। इसलिए केवल लाल बिंदुनुमा संरचनाओं की अधिक संख्या, अम्लीय ऑटोलाइसोसोम तक प्रक्रिया के आगे बढ़ने का समर्थन करती है। p62 प्रोटीन का घटता स्तर सामग्री के टर्नओवर की पुष्टि में सहायक हो सकता है। लेकिन ध्यान रखना चाहिए कि p62 का प्रतिलेखन स्वयं तनाव के प्रति प्रतिक्रिया करता है, इसलिए उसे mRNA स्तर पर भी जाँचना चाहिए।

नीचे दी गई जाँच सूची बताती है कि इस शोध साहित्य में इस्तेमाल किया गया प्रत्येक परीक्षण क्या मापता है और अकेले क्या सिद्ध नहीं कर सकता। पाठक मैक्रोऑटोफैजी से संबंधित किसी भी भावी दावे को परखने के लिए इसका उपयोग कर सकते हैं। इनमें उपवास और दीर्घायु से संबंधित तर्क भी शामिल हैं, जो इन्हीं मार्करों का सहारा लेते हैं।

परीक्षणयह क्या मापता हैयह अकेले क्या सिद्ध नहीं कर सकता
LC3B-I का स्तरलिपिडेशन के लिए उपलब्ध साइटोसोलिक पूर्ववर्ती प्रोटीनों के भंडार का आकारऑटोफैजी की गतिविधि; संश्लेषण और प्रसंस्करण भी इसे बदलते हैं
LC3B-II का स्तरऑटोफैजी संबंधी संरचनाओं पर झिल्ली से जुड़े LC3 की मात्रापूर्ण फ्लक्स; वृद्धि का अर्थ तेज़ निर्माण या निपटान में अवरोध हो सकता है
LC3 की बिंदुनुमा संरचनाएँ और केंद्रक के आसपास उनका एकत्रणपुटिका जैसी संरचनाओं में LC3 का पुनर्वितरणबदलाव की दिशा; स्थिर चित्र तेज़ प्रगति और प्रक्रिया में रुकावट के बीच अंतर नहीं कर सकते
क्लोरोक्वीन या बैफिलोमाइसिन A1 की मौजूदगी बनाम अनुपस्थिति में LC3-IIनिपटान अवरुद्ध होने पर नए ऑटोफैगोसोम बनते रहते हैं या नहींसामग्री का पूर्ण विघटन; अवरोधक का अल्पकालिक, अनुकूलित संपर्क आवश्यक है
p62 प्रोटीन का स्तरसामग्री को जोड़ने वाले एक अडैप्टर प्रोटीन का टर्नओवर, जो सामान्यतः ऑटोलाइसोसोम में नष्ट होता हैकेवल फ्लक्स; तनाव संबंधी मार्ग p62 के प्रतिलेखन को भी नियंत्रित करते हैं
टैंडम mCherry-GFP-LC3 रिपोर्टरअम्लीय ऑटोलाइसोसोम तक प्रगति, जिसमें पीले से केवल लाल संकेत में बदलाव होता हैहर प्रकार की सामग्री का पूर्ण विघटन
फॉस्फो-AMPK और फॉस्फो-ACCऊर्जा संबंधी तनाव संवेदक की सक्रिय भागीदारी और उसके प्रभावयह कि कोशिका के जीवित रहने का प्रभाव ऑटोफैजी के कारण हुआ; AMPK चयापचय की कई शाखाओं को नियंत्रित करता है
फॉस्फो-mTOR, p70S6K, 4EBP1वृद्धि संबंधी उस सिग्नलिंग मार्ग की गतिविधि जो ऑटोफैजी को रोकता हैफ्लक्स; ये शुरुआती चरणों में प्रक्रिया को अनुमति देने वाले संकेत हैं, निपटान के माप नहीं

शब्दावली की एक ऐसी गलती पर ध्यान दें जिससे यह तालिका बचाती है। फॉस्फोरिलेटेड ACC वह रूप है जिसकी एंज़ाइम गतिविधि अवरुद्ध होती है। इसकी वृद्धि AMPK का प्रभाव दिखाती है, ACC का सक्रियण नहीं।

"मैक्रोऑटोफैजी के अवरोध ने न्यूरोप्रोटेक्शन समाप्त कर दिया" वाक्यांश में भी इतनी ही सटीकता आवश्यक है। HT22 मॉडल में इसका अर्थ है कि ऑटोफैजी और लाइसोसोम मार्ग में हस्तक्षेप करने से सीरम की अनुपस्थिति में कोशिकाओं के जीवित रहने पर मेथिलीन ब्लू से मिलने वाला लाभ समाप्त हो गया। यह उस कोशिका कल्चर में ऑटोफैजी की आवश्यक या योगदानकारी भूमिका का समर्थन करता है। इससे यह स्थापित नहीं होता कि ऑटोफैजी इस यौगिक का एकमात्र सुरक्षात्मक तंत्र है। इससे यह भी सिद्ध नहीं होता कि क्लोरोक्वीन केवल ऑटोफैजी के माध्यम से कार्य करता है। कारणात्मक दावे को अधिक मज़बूत बनाने के लिए ATG5, ATG7 या ULK1 में आनुवंशिक हस्तक्षेप आवश्यक होगा।

एक ही प्रणाली तक पहुँचने के दो मार्ग

एक सरल मानचित्र उपयोगी है। ऊर्जा संबंधी तनाव AMPK को बढ़ाता है, AMPK, ULK1 कॉम्प्लेक्स को सक्रिय करता है और ऑटोफैजी शुरू होती है। वृद्धि कारक और पोषक तत्व mTORC1 को बढ़ाते हैं, mTORC1, ULK1 को रोकता है और ऑटोफैजी बंद रहती है। ULK1 के आगे, Beclin-1 और VPS34 कॉम्प्लेक्स फागोफोर के निर्माण की शुरुआत करता है। LC3-I का लिपिडेशन होकर LC3-II बनता है, ऑटोफैगोसोम बंद होता है, लाइसोसोम से जुड़ता है और भीतर की सामग्री का विघटन होता है। इस दौरान p62 का भी टर्नओवर होता है।

ऑटोफैजी मार्ग का आरेख, जिसमें AMPK और mTOR की शाखाएँ ULK1 पर मिलती हैं और हिप्पोकैम्पस तथा पूर्वज कोशिकाओं के प्रयोगों के अनुसार मेथिलीन ब्लू के निष्कर्ष दर्शाए गए हैं

इस आरेख में मेथिलीन ब्लू से संबंधित प्रत्येक निष्कर्ष को इस मानचित्र पर रखा गया है: हिप्पोकैम्पस का निष्कर्ष AMPK शाखा के पास और पूर्वज कोशिकाओं का निष्कर्ष mTOR शाखा के पास।

यह रूपरेखा Xie के दूसरे अध्ययन के साथ दिखने वाले विरोध को स्पष्ट करती है। विभाजित होकर संख्या बढ़ा रही चूहे की तंत्रिका पूर्वज कोशिकाओं में एक अलग प्रयोग ने पाया कि 5 μM मेथिलीन ब्लू ने कोशिका प्रसार को रोका और निष्क्रिय अवस्था में प्रवेश को बढ़ावा दिया। दिन 1 और 3 पर Ki67 पॉज़िटिव कोशिकाएँ घटीं, जबकि न्यूरॉन बनने की दिशा में प्रतिबद्ध कोशिकाओं का विभेदन बरकरार रहा। वहाँ तंत्र mTOR सिग्नलिंग के दमन के माध्यम से काम कर रहा था: कुल mTOR और फॉस्फोरिलेटेड mTOR में कमी के साथ p70S6K और 4EBP1 की अभिव्यक्ति घटी, और साइक्लिन E1, B1, D1 तथा D2 का डाउन-रेगुलेशन हुआ। प्रमुख रूप से देखा गया बदलाव पूर्वज कोशिकाओं की निष्क्रिय अवस्था था, जिसे लेखकों ने कोशिकीय जीर्णता में देरी से जोड़ा। यह तनावग्रस्त हिप्पोकैम्पस कोशिकाओं को बचाने वाला प्रभाव नहीं था।

इन दोनों शोधपत्रों के बीच कोई विरोधाभास नहीं है। AMPK और mTOR परिस्थितियों के अनुसार संकेतों को एकीकृत करते हैं; वे स्थिर स्विच नहीं हैं। तनावग्रस्त, न्यूरॉन जैसी कोशिका मापने योग्य mTOR अवरोध के बिना AMPK को सक्रिय कर सकती है। वहीं, कोशिका विभाजन को प्रेरित करने वाले संकेतों से संचालित पूर्वज कोशिका उसी यौगिक के प्रति प्रतिक्रिया करते हुए mTOR पर निर्भर वृद्धि प्रणाली को धीमा कर सकती है। कोशिका का प्रकार, तनाव की परिस्थिति, सांद्रता और मापने का समय तय करते हैं कि कौन-सी शाखा प्रमुख होगी। इसी कारण मेथिलीन ब्लू के माइटोकॉन्ड्रियल ऊर्जा और रेडॉक्स प्रभावों को भी इसी संदर्भ में देखना चाहिए। जैसा कि न्यूरोप्रोटेक्शन के तंत्रों की एक समीक्षा बताती है, यह यौगिक एक वैकल्पिक इलेक्ट्रॉन वाहक के रूप में कार्य करता है, एंटीऑक्सिडेंट और एपोप्टोसिस-रोधी सिग्नलिंग में भाग लेता है, MAO और NOS को रोकता है, और जैवजनन तथा ऑटोफैजी के माध्यम से माइटोकॉन्ड्रिया के नवीकरण से जुड़ता है। ऑटोफैजी इसके बहुविध प्रभावों की एक शाखा है, पूरी प्रक्रिया नहीं।

प्रयोग क्या नहीं दिखाते

सीरम से वंचित रखना कोशिका कल्चर में पोषण तथा अस्तित्व को सहारा देने वाले संकेतों की कमी और चयापचय संबंधी तनाव का मॉडल बनाता है। यह पूरे जीव के उपवास का मॉडल नहीं है: आधारभूत कल्चर माध्यम में ग्लूकोज़, अमीनो अम्ल और लवण बने रहते हैं, और भोजन करने का कोई व्यवहार मौजूद नहीं होता। कल्चर में इस्तेमाल की गई 20 nM से 5 μM तक की सांद्रताओं को गणना के आधार पर मनुष्यों की खुराक में नहीं बदला जा सकता, क्योंकि अवशोषण, प्रोटीन से बंधन, रेडॉक्स अवस्था, चयापचय, ऊतकों में संचय और संपर्क की अवधि सभी अलग होते हैं।

रोगियों में मेथिलीन ब्लू से प्रेरित ऑटोफैजिक फ्लक्स दिखाने के उद्देश्य से कोई मानव परीक्षण तैयार नहीं किया गया है। तंत्र संबंधी प्रमाण अभी भी कोशिकीय, शरीर से बाहर रखे ऊतकों और पशुओं पर किए गए कार्य तक सीमित हैं। समीक्षाएँ भी अब तक इन्हें मनुष्यों में लागू करने से संबंधित प्रमाण को प्रारंभिक बताती हैं। इसलिए ये अध्ययन यह नहीं दिखाते कि मेथिलीन ब्लू उपवास जैसा प्रभाव उत्पन्न करता है, ऑटोफैजी के माध्यम से मनुष्यों की आयु बढ़ाता है या मानव मस्तिष्क में ऑटोफैजिक फ्लक्स पूरा करता है। उपवास की नकल करने वाले प्रभाव और दीर्घायु संबंधी दावों के लिए अलग नैदानिक प्रमाण चाहिए। अन्य उपयोगों के लिए किए गए मेथिलीन ब्लू के मानव परीक्षण केवल संबंधित होने के कारण ऑटोफैजी के परीक्षण नहीं बन जाते। पोषक तत्वों की कमी से उत्पन्न तनाव और दीर्घायु के मॉडल संबंधी शोध को इस सीमा को ध्यान में रखकर पढ़ना चाहिए।

अगला शोधपत्र पढ़ते समय इस जाँच सूची को क्रम से लागू करें। पहले देखें कि किस शाखा में बदलाव हुआ: AMPK, mTOR या किसी में भी नहीं। फिर देखें कि LC3 के निष्कर्ष के साथ फ्लक्स परीक्षण किया गया था या वह अकेला निष्कर्ष है। इसके बाद जाँचें कि मार्ग को रोकने से लाभ समाप्त हुआ या नहीं, और उसे किस विधि से रोका गया। इन तीनों प्रश्नों का उत्तर देने वाला अध्ययन तंत्र संबंधी एक मज़बूत दावे का आधार देता है। केवल पहले प्रश्न का उत्तर देने वाले अध्ययन ने प्रक्रिया को अनुमति देने वाला संकेत दिखाया है; शेष प्रक्रिया अभी स्पष्ट नहीं हुई है।