Άρθρο
Κυανό του μεθυλενίου για τη χρώση DNA και RNA: εφαρμογές σε πηκτώματα και μεμβράνες

Ένας φοιτητής πραγματοποιεί ηλεκτροφόρηση σε πήκτωμα αγαρόζης, το χρωματίζει με κυανό του μεθυλενίου και δεν βλέπει τίποτα εκεί όπου περίμενε μια έντονη ζώνη. Στον διπλανό πάγκο, ένας μεταδιδακτορικός ερευνητής χρωματίζει μια μεμβράνη Northern με το ίδιο μπουκάλι κυανής χρωστικής και αποκτά ευκρινείς ριβοσωμικές ζώνες σε τρία λεπτά. Ο φοιτητής συμπεραίνει ότι η ηλεκτροφόρηση απέτυχε. Δεν απέτυχε. Οι δύο εργασίες ήταν διαφορετικές και η ίδια χρωστική ανταποκρίνεται σε αυτές με διαφορετική ευαισθησία, διαφορετικό υπόβαθρο και διαφορετικούς κανόνες για τα επόμενα στάδια.
Η χρώση DNA και η χρώση RNA με κυανό του μεθυλενίου βασίζονται στην ίδια χημεία, αλλά δεν έχουν τον ίδιο σκοπό. Σε ένα πήκτωμα, η χρωστική δείχνει πόσο νουκλεϊκό οξύ υπάρχει μέσα σε μια πορώδη μήτρα. Σε μια μεμβράνη, δείχνει αν η μεταφορά ήταν επιτυχής και αν οι διαδρομές φορτώθηκαν ομοιόμορφα. Μόλις γίνει σαφής αυτή η διάκριση, τα πρωτόκολλα, τα όρια ανίχνευσης και τα όρια συμβατότητας αποκτούν νόημα.
Η σύντομη απάντηση
Το κυανό του μεθυλενίου είναι μια επίπεδη κατιονική χρωστική που συνδέεται με τα νουκλεϊκά οξέα μη ομοιοπολικά και αναστρέψιμα, μέσω ενός συνδυασμού ηλεκτροστατικής έλξης προς τις φωσφορικές ομάδες, ενδοπαρεμβολής μεταξύ ζευγών βάσεων και σύνδεσης στη μικρή αύλακα. Αυτή η αναστρεψιμότητα είναι το ζητούμενο. Οι ζώνες μπορούν να χρωστούν, να παρατηρηθούν με ορατό φως, να καταγραφούν και στη συνέχεια να αποχρωματιστούν ή να καθαριστούν για κλωνοποίηση, υβριδισμό ή επαναϋβριδισμό με ανιχνευτή.
Για τη χρώση δίκλωνου DNA με κυανό του μεθυλενίου σε πήκτωμα αγαρόζης, η καθιερωμένη ταχεία συνταγή είναι 0.02 τοις εκατό w/v (200 μικρογραμμάρια ανά mL) σε νερό, περίπου 15 λεπτά χρώσης και περίπου 15 λεπτά αποχρωματισμού με νερό, με παρατήρηση σε φωτεινή τράπεζα λευκού φωτός. Για τις μεμβράνες, η κλασική συνταγή για αποτύπωση Northern είναι 0.02 έως 0.04 τοις εκατό χρωστική σε οξικό νάτριο με pH κοντά στο 5.2, χρώση για αρκετά λεπτά μετά τη μεταφορά και την ακινητοποίηση, έπειτα έκπλυση με νερό και πλήρης αποχρωματισμός πριν από τον υβριδισμό. Η ευαισθησία είναι μέτρια: δεκάδες έως εκατοντάδες νανογραμμάρια ανά ζώνη πηκτώματος υπό καλές συνθήκες, ενώ οι συντηρητικοί οδηγοί αναφέρουν 0.5 έως 1 μικρογραμμάριο. Αυτές οι ποσότητες είναι κατά τάξεις μεγέθους υψηλότερες από εκείνες που ανιχνεύουν το βρωμιούχο αιθίδιο και οι χρωστικές SYBR. Στις μεμβράνες δεν υπάρχει ένα χρήσιμο ενιαίο όριο ανίχνευσης για ένα συγκεκριμένο μετάγραφο, επειδή η χρώση δείχνει κυρίως το άφθονο ριβοσωμικό RNA και το συνολικό φορτωμένο υλικό. Μην αντικαθιστάτε τη χρωστική σε καμία από τις δύο συνταγές με διάλυμα συμπληρώματος του λιανεμπορίου. Οι επικυρωμένες μέθοδοι προϋποθέτουν χρωστική αναλυτικής καθαρότητας, καθορισμένα ρυθμιστικά διαλύματα και χειρισμό χωρίς RNάσες όταν χρησιμοποιείται RNA.
Πώς λειτουργεί η σύνδεση και πού παραπλανά
Το χρήσιμο μοντέλο έχει τρία μέρη. Πρώτον, το θετικά φορτισμένο σύστημα δακτυλίων έλκεται από τον αρνητικά φορτισμένο φωσφορικό σκελετό. Οι φασματοσκοπικές μελέτες δείχνουν ότι αυτή η ηλεκτροστατική συνιστώσα κυριαρχεί σε χαμηλή συγκέντρωση αλάτων, ενώ η μοντελοποίηση και η μοριακή δυναμική αναγνωρίζουν την ενδοπαρεμβολή και τη σύνδεση στη μικρή αύλακα ως σταθερούς τρόπους σύνδεσης με το δίκλωνο DNA, όπως συνοψίζεται σε μια φασματοσκοπική μελέτη της σύνδεσης του κυανού του μεθυλενίου με το DNA. Δεύτερον, υπάρχει κάποια προτίμηση για GC: η μοντελοποίηση ευνοεί τα βήματα CpG και GpC, ενώ τα πειράματα αναφέρουν προτιμησιακή σύνδεση με δίκλωνες δομές πλούσιες σε GC σε εργασίες για τις προτιμήσεις ενδοπαρεμβολής του κυανού του μεθυλενίου, αλλά συνδέονται και δίκλωνες δομές AT. Η συνήθης χρώση δεν είναι ειδική ως προς την αλληλουχία. Τρίτον, το μονόκλωνο DNA και το RNA συνδέονται κυρίως μέσω ηλεκτροστατικών αλληλεπιδράσεων και στοίβαξης με προσβάσιμες βάσεις και δίκλωνες περιοχές, γι’ αυτό η ένταση της χρώσης ποικίλλει ανάλογα με το μήκος, την αλληλουχία και τη δευτεροταγή δομή.
Ακολουθούν δύο συνέπειες. Επειδή η σύνδεση είναι μη ομοιοπολική, η χρωστική απομακρύνεται με την έκπλυση. Οι ζώνες πολυακρυλαμιδίου ξεθωριάζουν γρήγορα, εκτός αν στερεωθούν σκόπιμα, και υπάρχει ειδική παραλλαγή μόνιμης στερέωσης ακριβώς επειδή η κανονική χρώση είναι προσωρινή, όπως περιγράφεται από τους Soto και Draper για πηκτώματα PAGE. Επειδή η χρωστική είναι φωτοευαισθητοποιητής, ο παρατεταμένος έντονος φωτισμός χρωσμένου DNA παρουσία οξυγόνου μπορεί να οξειδώσει τη γουανίνη και τελικά να προκαλέσει μονόκλωνες θραύσεις, ένας μηχανισμός που αναλύεται σε εργασίες για την οξείδωση της γουανίνης με φωτοευαισθητοποίηση από κυανό του μεθυλενίου. Η σύντομη παρατήρηση με λευκό φως αποφεύγει τη γνωστή βλάβη από την υπεριώδη ακτινοβολία των κλασικών διαδικασιών με βρωμιούχο αιθίδιο, και αυτό το πλεονέκτημα είναι ουσιαστικό για την ανάκτηση υλικού σε παρασκευαστικές εφαρμογές. Το ορατό φως είναι ηπιότερο, όχι αβλαβές. Διατηρείτε σύντομο τον φωτισμό όταν το DNA πρόκειται να κλωνοποιηθεί. Για την ευρύτερη φωτοχημεία πίσω από αυτή την προφύλαξη, δείτε τις δύο οδούς στη φωτοχημεία του κυανού του μεθυλενίου. Για το οξειδοαναγωγικό ζεύγος και τις καταστάσεις φορτίου που εξηγούν γιατί η οξειδωμένη μορφή συνδέεται ενώ η ανηγμένη όχι, δείτε τη χημεία της δομής και των ιδιοτήτων του κυανού του μεθυλενίου.
Πρώτη εργασία: χρώση μέσα σε πηκτώματα
Η χρώση πηκτώματος απαντά σε ένα ερώτημα: υπάρχει αρκετό νουκλεϊκό οξύ σε αυτή τη ζώνη ώστε να είναι ορατό με το μάτι; Το δίκλωνο DNA σε αγαρόζη είναι η καλύτερα χαρακτηρισμένη περίπτωση. Η αρχική μέθοδος χρώσης πηκτωμάτων με κυανό του μεθυλενίου των Flores και συνεργατών επικύρωσε το ταχύ πρωτόκολλο 0.02 τοις εκατό σε αγαρόζη 1 τοις εκατό και έδειξε επιτυχή ανάκτηση και επακόλουθη κλωνοποίηση. Το ίδιο πρωτόκολλο του προμηθευτή εμφανίζεται στη σελίδα προϊόντος κυανού του μεθυλενίου της IBI Scientific, όπου παρατίθενται μαζί η συνταγή 0.04 τοις εκατό για μεμβράνες και η ταχεία παραλλαγή για πηκτώματα.
Πρακτική διαδικασία:
- Πραγματοποιήστε την ηλεκτροφόρηση κανονικά. Χρωματίστε μετά την ηλεκτροφόρηση, όχι κατά τη διάρκειά της, εκτός αν η μεταφορά ή η διακριτική ικανότητα έχει επικυρωθεί για μια τροποποιημένη μέθοδο.
- Βυθίστε το πήκτωμα σε κυανό του μεθυλενίου 0.02 τοις εκατό w/v σε απεσταγμένο νερό, με ήπια ανακίνηση, για περίπου 15 λεπτά.
- Αποχρωματίστε με αρκετές αλλαγές νερού, για περίπου 15 λεπτά συνολικά, μέχρι να μειωθεί το υπόβαθρο της μήτρας και να ξεχωρίζουν οι ζώνες.
- Φωτογραφίστε αμέσως σε συσκευή φωτισμού λευκού φωτός.
Η αγαρόζη και το πολυακρυλαμίδιο συμπεριφέρονται διαφορετικά. Η αγαρόζη συγκρατεί τη χρωστική στη μήτρα, οπότε ο αποχρωματισμός είναι το αργό στάδιο. Τα λεπτά πηκτώματα πολυακρυλαμιδίου χρωματίζονται γρήγορα, αλλά χάνουν επίσης γρήγορα τη χρωστική, κάτι που διευκολύνει την παρασκευαστική εκτομή και δυσχεραίνει την αρχειακή καταγραφή. Τα συνθετικά ολιγονουκλεοτίδια σε πολυακρυλαμίδιο μπορούν να εντοπιστούν με την ίδια συνταγή 0.02 τοις εκατό σε 20 έως 30 λεπτά, με επανειλημμένες εκπλύσεις με νερό, ακολουθώντας καθιερωμένες μεθόδους PAGE του τύπου Current Protocols. Έχουν αναφερθεί πολύ αραιές παραλλαγές, κοντά στο 0.0002 τοις εκατό σε αραιό TBE, για παρασκευαστικά ολιγονουκλεοτίδια σε διάστημα αρκετών ωρών, αλλά η τεκμηρίωση είναι ασθενέστερη.
Η διάκριση μεταξύ DNA και RNA έχει σημασία. Το δίκλωνο DNA παρουσιάζει την ισχυρότερη δομικά οργανωμένη σύνδεση. Το RNA και το μονόκλωνο DNA χρωματίζονται, αλλά πιο ασθενώς και λιγότερο προβλέψιμα. Για πηκτώματα RNA από αγαρόζη με φορμαλδεΰδη, τα περισσότερα εργαστήρια παραλείπουν τη χρώση με κυανό μέσα στο πήκτωμα και μεταφέρουν πρώτα το RNA σε μεμβράνη, όπου και το χρωματίζουν. Αυτή η επιλογή αντικαθιστά ένα ασθενές σήμα στο πήκτωμα με ένα ευκρινέστερο σήμα στη μεμβράνη, παρέχοντας παράλληλα καταγραφή της φόρτωσης.
Δεύτερη εργασία: χρώση πάνω σε μεμβράνες
Η χρώση μεμβράνης απαντά σε ένα διαφορετικό ερώτημα: ήταν επιτυχής η μεταφορά και είναι συγκρίσιμες οι διαδρομές; Η κλασική εφαρμογή είναι η αναστρέψιμη χρώση αποτύπωσης Northern των Herrin και Schmidt, αρχικά με χρωστική 0.04 τοις εκατό σε οξικό νάτριο 50 mM σε pH 5.0 για 2 έως 3 λεπτά, με έκπλυση με νερό και απομάκρυνση με αραιό SDS σε SSPE πριν από τον υβριδισμό.
Η ευρέως χρησιμοποιούμενη σύγχρονη παραλλαγή εφαρμόζεται ως εξής:
- Μεταφέρετε RNA ή μετουσιωμένο DNA σε νάιλον ή νιτροκυτταρίνη και στη συνέχεια ακινητοποιήστε το με διασύνδεση μέσω υπεριώδους ακτινοβολίας ή με θέρμανση, ώστε το δείγμα να μη χαθεί κατά τη χρώση.
- Προαιρετικό αλλά συνηθισμένο: διαβρέξτε τη μεμβράνη σε οξικό οξύ 5 τοις εκατό για περίπου 15 λεπτά.
- Χρωματίστε για 5 έως 10 λεπτά σε κυανό του μεθυλενίου 0.02 έως 0.04 τοις εκατό σε οξικό νάτριο 0.3 έως 0.5 M με pH κοντά στο 5.2.
- Ξεπλύνετε και αποχρωματίστε με νερό για 5 έως 15 λεπτά, καταγράψτε την εικόνα και έπειτα απομακρύνετε την υπολειμματική χρωστική πριν από τον υβριδισμό.
Το θετικά φορτισμένο νάιλον κυριαρχεί στις εφαρμογές Northern. Η νιτροκυτταρίνη λειτουργεί επίσης με την ίδια διαδικασία οξικού οξέος και οξικού άλατος. Η εικόνα χρησιμοποιείται για να επιβεβαιωθεί η μεταφορά, να συγκριθούν οι ζώνες 28S και 18S (ή 23S και 16S για βακτηριακό RNA), να σημειωθούν οι δείκτες μεγέθους και τα πρότυπα και να διατηρηθεί μια κατά προσέγγιση καταγραφή για κανονικοποίηση ως προς το συνολικό RNA. Δημοσιευμένες μέθοδοι Northern ποσοτικοποιούν τις χρωσμένες ριβοσωμικές ζώνες για ελέγχους φόρτωσης, μεταξύ άλλων και σε εργασία στον τομέα της επιστήμης των γαλακτοκομικών που χρησιμοποίησε ριβοσωμικές ζώνες χρωσμένες με κυανό του μεθυλενίου για κανονικοποίηση. Οι μεμβράνες Southern μπορούν να απεικονιστούν με τον ίδιο τρόπο, αλλά η χρωστική είναι πολύ πιο καθιερωμένη ως μέσο ελέγχου φόρτωσης και μεταφοράς στην αποτύπωση Northern. Επιπλέον, το DNA στην αποτύπωση Southern μετουσιώνεται πριν από τη μεταφορά, επομένως οι τιμές ευαισθησίας των πηκτωμάτων δεν ισχύουν αυτούσιες.

Όρια ανίχνευσης και υπόβαθρο: πού υστερεί το κυανό
Η παρακάτω σύγκριση είναι σκόπιμα προσεγγιστική. Η απόδοση της χρώσης εξαρτάται από το ποσοστό του πηκτώματος, το πλάτος της ζώνης, τα οπτικά μέσα και την προσεκτική εφαρμογή του αποχρωματισμού. Αντιμετωπίστε κάθε αριθμό ως τάξη μεγέθους, όχι ως προδιαγραφή.
| Χρωστική και μορφή εφαρμογής | Κατά προσέγγιση όριο ανίχνευσης ανά ζώνη | Ερμηνεία |
|---|---|---|
| Κυανό του μεθυλενίου, dsDNA σε αγαρόζη | 40 έως 250 ng με βελτιστοποίηση· 0.5 έως 1 μικρογραμμάριο με συντηρητική εκτίμηση | Επαρκές για παρασκευαστικές ποσότητες φόρτωσης και εκπαιδευτικά πηκτώματα. Ανεπαρκές για ζώνες με ίχνη υλικού. |
| Κυανό του μεθυλενίου, βραχύ ssDNA ή RNA ή ολιγονουκλεοτίδια σε PAGE | Περίπου 0.1 έως 0.5 μικρογραμμάριο | Εξαρτάται από το μήκος και τη δομή. Δεν υπάρχει καθολικό όριο. |
| Βρωμιούχο αιθίδιο, dsDNA σε αγαρόζη | Περίπου 1 έως 10 ng | Περίπου τετραπλάσια ευαισθησία από τη βελτιστοποιημένη χρώση με κυανό στη σύγκριση των Flores. Απαιτεί υπεριώδη ακτινοβολία. |
| SYBR Green I, dsDNA | Περίπου 60 pg | Απαιτείται απεικόνιση φθορισμού. |
| SYBR Gold, DNA και RNA | Περίπου 25 pg | Πάνω από δεκαπλάσια ευαισθησία από το βρωμιούχο αιθίδιο σε αρκετές μορφές εφαρμογής. |
| Χρώση αργύρου, νουκλεϊκά οξέα σε PAGE | Περίπου 0.3 έως 0.9 ng· έχουν αναφερθεί 100 pg RNA σε βελτιστοποιημένη διαδοχή χρώσης με κυανό και έπειτα άργυρο | Πολύ ευαίσθητη, αλλά με σύνθετη χημική διαδικασία και περιορισμένη καταλληλότητα για ανάκτηση. |
| Κυανό της τολουϊδίνης, RNA και ολιγονουκλεοτίδια σε PAGE | Ποσότητες εργασίας εκατοντάδων ng, με τεκμηριωμένη τιμή περίπου 250 ng | Παρατήρηση με ορατό φως όπως το κυανό του μεθυλενίου, αλλά χωρίς τυποποιημένο όριο συγκρίσιμο με τις προδιαγραφές SYBR. |
Ο έλεγχος του υποβάθρου καθορίζει αν το μέτριο σήμα είναι αξιοποιήσιμο. Η ελεύθερη χρωστική έχει έντονο χρώμα, επομένως η αντίθεση προκύπτει από την απομάκρυνση της μη συνδεδεμένης χρωστικής χωρίς απομάκρυνση της συνδεδεμένης. Μια πιο συμπυκνωμένη χρωστική σπάνια αυξάνει την ευαισθησία. Κυρίως αυξάνει τον χρόνο αποχρωματισμού. Δοκιμάστε μια σειρά αραιώσεων στο συγκεκριμένο πήκτωμα, στη συγκεκριμένη μεμβράνη και με τη συγκεκριμένη κάμερα και χρησιμοποιήστε μόνο το εύρος στο οποίο η ολοκληρωμένη πυκνότητα παραμένει ανάλογη της αρχικής ποσότητας. Το κυανό του μεθυλενίου υποστηρίζει ημιποσοτική κανονικοποίηση της φόρτωσης. Δεν αποτελεί ποσοτική δοκιμασία μεγάλου δυναμικού εύρους, επειδή η χωρητικότητα της μεμβράνης, η απόδοση μεταφοράς, ο κορεσμός και ο αποχρωματισμός διαφέρουν από διαδρομή σε διαδρομή.
Όρια συμβατότητας: τι παραμένει λειτουργικό μετά τη χρώση
Η κλωνοποίηση μετά από χρώση με κυανό έχει αποδειχθεί. Οι Flores και συνεργάτες έκοψαν χρωσμένες ζώνες αγαρόζης, ανέκτησαν το DNA και πραγματοποίησαν σύνδεση και μετασχηματισμό, αναφέροντας καλύτερα αποτελέσματα κλωνοποίησης από ό,τι μετά από χρώση με βρωμιούχο αιθίδιο και έκθεση σε υπεριώδη ακτινοβολία. Η πιθανή αιτία είναι η μικρότερη φωτοβλάβη, όχι κάποιο όφελος από την ίδια τη χρωστική. Διατηρείτε σύντομη την έκθεση σε λευκό φως και καθαρίζετε το ανακτημένο DNA με μια συνήθη διαδικασία εκχύλισης από πήκτωμα.
Για την PCR και την αλληλούχηση, η τεκμηρίωση είναι πιο περιορισμένη. Η υπολειμματική χρωστική συνδέεται με τα νουκλεϊκά οξέα, επομένως απαιτούνται αποχρωματισμός και καθαρισμός πριν από τα ενζυμικά στάδια. Το DNA που έχει καθαριστεί σωστά από πήκτωμα χρωσμένο με κυανό αναμένεται να λειτουργεί, αλλά η ανοχή στη μεταφορά υπολειμματικής χρωστικής δεν έχει ποσοτικοποιηθεί επαρκώς για διαφορετικές πολυμεράσες και χημείες αλληλούχησης. Μην τη θεωρείτε δεδομένη.
Ο υβριδισμός σε αποτύπωμα είναι συμβατός όταν τηρείται αυστηρά η σειρά: μεταφορά, ακινητοποίηση, χρώση, καταγραφή, αποχρωματισμός, υβριδισμός. Αυτή η αλληλουχία αποτελεί τον σχεδιασμό των Herrin και Schmidt. Η χρώση πριν από τη μεταφορά ή η παράλειψη του αποχρωματισμού συνιστά διαφορετική μέθοδο και χρειάζεται ξεχωριστή επικύρωση. Μετά την απομάκρυνση της χρωστικής, η συνήθης απομάκρυνση του ανιχνευτή και ο επαναϋβριδισμός προχωρούν κανονικά. Για τη χρώση σε επίπεδο κυττάρων με την ίδια οικογένεια χρωστικών και για το γιατί η λογική των στερεωμένων επιχρισμάτων δεν εφαρμόζεται σε μεθόδους ζωντανών κυττάρων, δείτε τον άτλαντα χρώσεων μικροσκοπίας.
Η εκτομή ζωνών λειτουργεί για παρασκευαστικά πηκτώματα αγαρόζης και για ολιγονουκλεοτίδια σε PAGE που εντοπίζονται με κυανό, εφόσον αποφεύγεται η παραλλαγή μόνιμης στερέωσης. Η ηλεκτροέκλουση μετά τον αποχρωματισμό είναι χημικά εύλογη για μια ουσία με αναστρέψιμη σύνδεση, αλλά τα ελεγχόμενα δεδομένα απόδοσης ειδικά για το κυανό του μεθυλενίου είναι περιορισμένα. Πραγματοποιήστε αφαλάτωση ή κατακρήμνιση μετά την έκλουση.
Επαναλαμβανόμενα προβλήματα
Οι αχνές ζώνες πηκτώματος συνήθως σημαίνουν πολύ μικρή ποσότητα υλικού για μια χρωματομετρική χρώση, ιδιαίτερα για βραχείς μονόκλωνους στόχους ή στόχους RNA. Φορτώστε περισσότερο υλικό, χρησιμοποιήστε φρέσκια χρωστική, παρατείνετε τη χρώση πριν αυξήσετε τη συγκέντρωση και σταματήστε νωρίτερα τον αποχρωματισμό. Ένα ομοιόμορφα κυανό πήκτωμα χωρίς αντίθεση συνήθως υποδηλώνει υπερβολική χρώση ή πολύ λίγες αλλαγές νερού. Το ξεθώριασμα των ζωνών PAGE είναι αναμενόμενη χημική συμπεριφορά, όχι αποτυχία της χρώσης. Φωτογραφίστε γρήγορα. Το ανομοιόμορφο υπόβαθρο στη μεμβράνη υποδεικνύει πτυχώσεις, φυσαλίδες, δακτυλικά αποτυπώματα, ανομοιόμορφη ανακίνηση ή ανομοιογενή μεταφορά. Μην το ερμηνεύετε ως άνιση φόρτωση χωρίς έλεγχο υβριδισμού. Ένα ασθενές, διάχυτο ριβοσωμικό πρότυπο μπορεί να σημαίνει αποικοδόμηση, αλλά και ατελή μεταφορά, πολύ λίγο συνολικό RNA (οι συνήθεις διαδρομές περιέχουν από αρκετά έως δεκάδες μικρογραμμάρια) ή υπερβολικό αποχρωματισμό. Η χρωστική αναδεικνύει το άφθονο ριβοσωμικό RNA. Δεν ανιχνεύει ένα συγκεκριμένο μετάγραφο. Αυτή είναι η δουλειά του ανιχνευτή.
Ασφάλεια και χειρισμός χωρίς υπερβολικούς ισχυρισμούς
Το κυανό του μεθυλενίου είναι απλούστερο στον χειρισμό από το βρωμιούχο αιθίδιο, αλλά δεν είναι αβλαβές. Ένα ισχύον δελτίο δεδομένων ασφαλείας της MilliporeSigma κατατάσσει τη χρωστική στην Κατηγορία 4 οξείας τοξικότητας από του στόματος, επιβλαβής σε περίπτωση κατάποσης, με διάθεση μέσω εγκεκριμένης οδού διαχείρισης αποβλήτων σύμφωνα με το δελτίο δεδομένων ασφαλείας του κυανού του μεθυλενίου της Sigma-Aldrich. Το βρωμιούχο αιθίδιο συνοδεύεται από αυστηρότερες προειδοποιήσεις γονοτοξικότητας, συμπεριλαμβανομένων ύποπτων επιδράσεων στα γεννητικά κύτταρα στο δελτίο δεδομένων ασφαλείας του βρωμιούχου αιθιδίου της Sigma-Aldrich, και τα πηκτώματα και τα διαλύματά του συνήθως διαχωρίζονται ως επικίνδυνα χημικά απόβλητα, όπως σημειώνεται στον οδηγό χρωστικών νουκλεϊκών οξέων της Thermo Fisher. Ακολουθείτε τα δελτία δεδομένων ασφαλείας και τους κανόνες του φορέα σας και για τις δύο ουσίες. Διατηρείτε την ξηρή χρωστική στεγνή και ερμητικά κλεισμένη, επαναχρησιμοποιείτε το διάλυμα χρώσης μόνο όπως επιτρέπει το πρωτόκολλο, αποθηκεύετε τις χρωσμένες μεμβράνες στεγνές ανάμεσα σε φύλλα διηθητικού χαρτιού και φωτογραφίζετε τα πηκτώματα πριν χαθούν οι ζώνες λόγω διάχυσης.
Θυμηθείτε τη βασική αρχή στον εργαστηριακό πάγκο. Τα πηκτώματα ελέγχουν την ορατότητα σε υψηλό φορτίο υπό λευκό φως. Οι μεμβράνες ελέγχουν τη μεταφορά και τη φόρτωση πριν ο ανιχνευτής αναλάβει την ευαίσθητη ανίχνευση. Μία χρωστική εξυπηρετεί και τις δύο εργασίες, με μέτρια ευαισθησία, αναστρέψιμη σύνδεση και αυστηρή σειρά ενεργειών.