Artikel

Adakah penggunaan oksigen yang lebih tinggi bermakna lebih banyak ATP? Pengajaran daripada kajian metilena biru

Adakah penggunaan oksigen yang lebih tinggi bermakna lebih banyak ATP? Pengajaran daripada kajian metilena biru

Satu mitokondrion terasing berada di dalam kebuk dengan bahan api tetapi tanpa ADP. Ia menggunakan oksigen secara perlahan. Apabila ADP ditambah, penggunaan oksigen melonjak beberapa kali ganda. Tunggu sehingga ADP habis dan penggunaan oksigen menurun semula. Bahan api tidak pernah berubah. Hanya permintaan terhadap ATP yang berubah.

Urutan ringkas itu merangkumi seluruh perbezaan yang dibincangkan dalam artikel ini. Penggunaan oksigen mengukur kelajuan elektron mengalir melalui rantai respirasi menuju oksigen. Penghasilan ATP mengukur berapa banyak daripada aliran itu yang ditangkap sebagai tenaga yang boleh digunakan. Kedua-duanya berkongsi satu langkah perantaraan, iaitu kecerunan proton merentasi membran dalaman mitokondria, dan apa-apa yang mengubah seberapa erat kecerunan itu digandingkan dengan sintesis ATP boleh menggerakkan kedua-dua ukuran hasil tersebut ke arah yang berbeza. Metilena biru merupakan contoh yang berguna di sini kerana kedua-dua kesannya telah diperhatikan: meningkatkan penggunaan oksigen bersama ATP dalam sesetengah sediaan, dan meningkatkan penggunaan oksigen ketika ATP kekal tidak berubah atau menurun dalam sediaan lain.

Pembaca yang mahu memahami gambaran pemindahan elektron yang lebih luas terlebih dahulu boleh bermula dengan cara metilena biru mengangkut elektron melalui rantai respirasi, manakala pembaca yang mahu memahami istilah eksperimen oksigen awal boleh membaca perkara yang sebenarnya ditunjukkan oleh pengukuran respirasi pertama.

Respirasi, ATP dan kecerunan di antaranya

Elektron daripada NADH dan FADH2 memasuki rantai pada kompleks I dan II, melalui kompleks III ke sitokrom c, kemudian melalui kompleks IV ke oksigen. Tenaga yang dibebaskan pada kompleks I, III dan IV mengepam proton keluar dari matriks ke ruang antara membran. Pemisahan cas dan keasidan itu membentuk daya gerak proton, dan komponen elektriknya, iaitu keupayaan membran, biasanya merupakan komponen dominan.

ATP sintase membolehkan proton mengalir kembali ke dalam matriks dan menggunakan tenaga yang dibebaskan untuk menggabungkan ADP dan fosfat menjadi ATP. Jadi, urutannya ialah:

penggunaan oksigen, kemudian pengepaman proton, kemudian kecerunan, kemudian sintesis ATP.

Namun, proton boleh kembali melalui laluan lain. Sebarang aliran kembali yang memintas ATP sintase ialah kebocoran proton. Kebocoran memaksa rantai mengepam proton yang sama sekali lagi untuk mengekalkan keupayaan membran, lalu menggunakan lebih banyak oksigen tanpa menghasilkan lebih banyak ATP. Kebocoran yang cukup kuat menyebabkan nyahgandingan: penggunaan oksigen meningkat sementara ATP kekal tidak berubah atau menurun, dan tenaga yang terbuang dilepaskan sebagai haba.

Keadaan 3, keadaan 4 dan nisbah kawalan respirasi

Istilah klasik untuk hal ini berasal daripada kajian mitokondria terasing. Keadaan 3 ialah respirasi dengan substrat serta ADP hadir: ATP sintase mengurangkan kecerunan, keupayaan membran menurun, rantai mempercepat alirannya untuk membina semula kecerunan itu, dan penggunaan oksigen tinggi kerana ATP sedang dihasilkan. Keadaan 4 ialah respirasi selepas ADP habis: ATP sintase menjadi tidak aktif, kecerunan meningkat, keupayaan membran yang tinggi menentang pengepaman selanjutnya, dan penggunaan oksigen menurun ke tahap yang diperlukan untuk mengimbangi kebocoran.

Oleh itu, nisbah kawalan respirasi, iaitu keadaan 3 dibahagikan dengan keadaan 4, menunjukkan seberapa erat gandingan dalam sediaan tersebut. Nisbah yang tinggi bermakna ADP mengawal respirasi dengan kuat. Nisbah yang menurun bersama peningkatan keadaan 4 bermakna kebocoran semakin mengambil alih. Inilah sudut pandang yang membantu kita memahami hasil metilena biru di bawah.

Satu model pemikiran wajar diingati. Keupayaan membran yang tinggi memperlahankan rantai. Pengurangan keupayaan itu mempercepatnya. Rantai bertindak balas terhadap betapa sukarnya pengepaman, bukan secara langsung terhadap sama ada ATP sedang dihasilkan.

Apabila ukuran hasil berubah seiring

Contoh gandingan yang paling jelas datang daripada mitokondria otak marmut terasing dengan kompleks respirasi yang disekat. Pada kepekatan metilena biru 100 nanomolar hingga 1 micromolar, penggunaan oksigen rehat meningkat dengan glutamat bersama malat, suksinat atau gliserofosfat sebagai bahan api, sementara respirasi yang dirangsang oleh ADP tidak berubah. Dalam mitokondria yang diracuni pada kompleks I atau kompleks III, pewarna itu meningkatkan penghasilan ATP secara sederhana, memulihkan keupayaan membran dan memperbaik pengambilan kalsium. Laluan yang dicadangkan ialah jalan pintas: pewarna menerima elektron sebelum titik sekatan dan menyerahkannya kepada sitokrom c, sekali gus memintas kompleks yang rosak.

Kes gandingan kedua menggunakan sumber ATP yang sama sekali berbeza. Dalam mitokondria otak terasing dengan ATP sintase yang direncat, metilena biru masih merangsang respirasi pada setiap substrat yang diuji. Namun, sintesis ATP hanya meningkat pada alfa ketoglutarat dan glutamat, iaitu dua substrat yang membentuk suksinil CoA. Dengan oligomisin menyekat ATP sintase, ATP tambahan berasal daripada pemfosforilan pada peringkat substrat oleh suksinil CoA ligase dalam kitaran asid sitrik, bukan daripada pemfosforilan oksidatif. Pewarna itu juga memulihkan keupayaan membran apabila kompleks I dan ATP sintase direncat serentak. Di sini, penggunaan oksigen dan ATP berubah seiring, tetapi hanya apabila substrat membolehkan laluan ATP kedua itu berlaku. Pada suksinat atau malat, respirasi meningkat tanpa ATP tambahan. Pewarna yang sama, kebuk yang sama, bahan api berbeza, jawapan berbeza.

Apabila ukuran hasil menyimpang

Kes penyimpangan juga telah diterbitkan dan sama bernilainya sebagai pengajaran. Dalam kajian mitokondria hati tikus terasing pada 1997, metilena biru mempercepat respirasi keadaan 4 dalam mitokondria yang bergandingan erat dan menggunakan suksinat untuk respirasi, lalu menurunkan nisbah kawalan respirasi. Kesan itu dapat dilihat mulai 0.5 micromolar dan kuat pada 5 micromolar, iaitu kepekatan yang hampir dengan paras plasma selepas bolus intravena 100 milligram. Pada 5 micromolar, mitokondria turut membengkak, walaupun kecacatan gandingan muncul terlebih dahulu pada kepekatan yang lebih rendah. Ini menyokong tafsiran bahawa kebocoran mendahului kerosakan struktur, bukannya berpunca daripadanya. Dalam mitokondria yang dinyahgandingkan, pewarna itu merangsang respirasi dengan cara yang bergantung pada kepekatan dan boleh mencapai ketepuan. Penggunaan oksigen meningkat dalam kedua-dua sediaan. Sintesis ATP bagi setiap oksigen yang digunakan tidak meningkat. Itulah contoh klasik nyahgandingan bersama pengangkutan elektron, dalam molekul yang sama.

Penyimpangan yang paling ketara datang daripada retina. Dalam mencit yang kekurangan AIF dan sel fotoreseptor yang dirawat dengan rotenon, metilena biru mengekalkan ketebalan retina, penanda fotoreseptor dan struktur mitokondria, serta menurunkan nisbah NADH kepada NAD dan meredakan laluan tekanan termasuk respons protein tidak terlipat dan mitofagi. Semua ini berlaku tanpa membetulkan kekurangan ATP. Perlindungan tanpa pemulihan tenaga bermakna manfaat itu berlaku melalui keseimbangan redoks dan integriti mitokondria, bukan melalui ATP tambahan. Sesiapa yang menyamakan kelangsungan hidup tisu dengan pemulihan pengeluaran tenaga akan tersalah tafsir eksperimen itu sepenuhnya.

Kajian mitokondria otak menambah sisi kos kepada gambaran yang sama. Kepekatan rendah yang sama yang memperbaik bioenergetik turut meningkatkan penghasilan hidrogen peroksida dalam setiap keadaan yang diuji dan memperlahankan penyingkirannya, berdasarkan pengukuran dengan asai Amplex yang ditentukur, bukannya pewarna tidak khusus. Lebih banyak ATP hadir bersama lebih banyak oksidan.

Senarai semak praktikal untuk membaca hasil kajian

Empat soalan membezakan hasil yang bergandingan daripada hasil yang tidak bergandingan.

Pertama, ukuran hasil manakah yang sebenarnya diukur. Penggunaan oksigen sahaja tidak dapat menunjukkan ATP. Sintesis ATP, keupayaan membran dan nisbah kawalan respirasi masing-masing menambah satu maklumat yang tidak dapat dikesan oleh elektrod oksigen. Panduan membaca dakwaan penyelidikan metilena biru menerangkan disiplin penilaian ukuran hasil ini secara terperinci.

Kedua, substrat manakah yang membekalkan bahan api kepada mitokondria. Hasil suksinil CoA menunjukkan bahawa pilihan bahan api boleh menentukan sama ada respirasi tambahan dapat menghasilkan ATP tambahan sama sekali.

Ketiga, kepekatan manakah yang digunakan. Metilena biru pada kepekatan nanomolar hingga micromolar rendah dalam mitokondria otak memberikan peningkatan bioenergetik sederhana dengan kos oksidan; setengah micromolar dan ke atas dalam mitokondria hati melemahkan gandingan; 5 micromolar turut menyebabkan pembengkakan. Kepekatan ialah sebahagian daripada mekanisme, bukan butiran latar belakang.

Keempat, model manakah yang menghasilkan dapatan itu. Mitokondria terasing mendedahkan susunan laluannya, tetapi sel dan tisu utuh menambah faktor pengangkutan, penurunan kepada bentuk tidak berwarna dan destinasi penerima elektron yang saling bersaing. Kajian pendosan makmal, termasuk cara kepekatan dan protokol membentuk kesan metilena biru, menjadi jambatan antara angka dalam kebuk dan sebarang dakwaan tentang seseorang.

Perbandingan ukuran hasil dalam empat panel. Kiri atas, pintasan bergandingan: penggunaan oksigen meningkat dan ATP meningkat apabila kompleks I atau III disekat, berlabel Tretter 2014 mitokondria otak. Kanan atas, bergantung pada substrat: penggunaan oksigen meningkat pada semua bahan api tetapi ATP hanya meningkat pada alfa ketoglutarat dan glutamat melalui suksinil CoA ligase, berlabel Komlodi 2017. Kiri bawah, dinyahgandingkan: respirasi keadaan 4 meningkat, nisbah kawalan respirasi menurun, pembengkakan pada 5 micromolar, berlabel Visarius 1997 mitokondria hati. Kanan bawah, dilindungi tanpa ATP: tisu terpelihara dan nisbah NADH kepada NAD dinormalkan sementara ATP kekal rendah, berlabel Mekala 2019 retina. Teks di bahagian bawah menyatakan penggunaan oksigen menunjukkan aliran elektron, ATP menunjukkan tenaga yang ditangkap.

Penggunaan oksigen menunjukkan aliran elektron. ATP menunjukkan berapa banyak daripada aliran itu yang ditangkap. Metilena biru boleh mengubah salah satu daripadanya, dan eksperimen di atas menunjukkan keempat-empat kombinasi yang terhasil: kedua-duanya meningkat, respirasi meningkat hanya apabila substrat membenarkannya, respirasi meningkat sementara gandingan menurun, dan tisu terpelihara sementara ATP kekal tidak berubah. Angka pada elektrod oksigen ialah permulaan tafsiran, bukan penghujungnya.